רפי מוקדי, יליד 1929, הוא ד"ר למדעי הקרקע והמים בטכניון בחיפה, אבא ל-3 ילדים ומפקד פלוגת-סיור חטיבתית במילואים. ב-9 ביוני 1967 (מלחמת ששת הימים), רב-סרן רפי מוקדי עומד בראש צוות סיור שתפקידו להוביל את החטיבה בקרב הפריצה לרמת-הגולן. מהלך הקרב רצוף שיבושים והסתבכויות אשר בולמים שוב ושוב את מאמציו של רפי לכוון את כוחות החטיבה. אבל רפי לא מוותר – הוא יעשה כל מה שהוא יכול כדי להחזיר את מהלך הקרב למסלול, ולחסוך את הנפגעים שיהיו לחטיבה בהמשך. בשיאם של מאמציו אלה, בעודו לוחם כמפקד גדוד – רפי נפגע.
כשהקרב מסתיים ורפי נשאר פצוע בשטח, הוא בטוח שהעזרה לא תאחר להגיע.
הסיפור ההיסטורי המוצג ב-אם תמשוך צפונה גובש בעקבות תחקיר מעמיק שערכו הבמאיות, במהלכו התגלו פריטי מידע רבים שהיו עלומים עד כה. הסרט עוקב אחרי אירועי הימים הארוכים שבהם רפי לבד בשטח, תוך פריסה הדרגתית של מהלך הקרב שהוביל לימים האלה, והצצות לפלאשבקים מ-38 שנות חיים. כך נטווה סיפורו הבלתי-נתפס של רפי מוקדי. סיפור על נאמנות, שלא רצו שייחשף.